A causa da maioria dos tumores primários da coluna vertebral é desconhecida. Alguns deles podem ser atribuídos à exposição a agentes cancerígenos. Linfomas na medula espinhal, que são cânceres que afetam os linfócitos, são mais comuns em pessoas com o sistema imunológico comprometido.
Em um pequeno número de casos, os tumores primários podem resultar da presença de doenças genéticas.
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